尖孢镰刀菌寄主专化型脂肪酸生物标记鉴别特性
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘波
作者: 刘波;胡桂萍;肖荣凤
作者机构:
关键词: 尖孢镰刀菌;脂肪酸;寄主专化型;判别模型;生物标记
期刊名称: 中国农业科学
ISSN: 0578-1752
年卷期: 2012 年 45 卷 24 期
页码: 4998-5012
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】分析不同寄主尖孢镰刀菌脂肪酸生物标记的结构组成和分布特性,建立尖孢镰刀菌寄主专化型脂肪酸生物标记鉴别模型。【方法】通过脂肪酸鉴定系统(Sherlock MIS)对来自于西瓜、香蕉和花生寄主的22株尖孢镰刀菌进行脂肪酸生物标记检测,采用聚类分析方法分析尖孢镰刀菌脂肪酸的同质性,采用主成分分析提取尖孢镰刀菌寄主专化型特征脂肪酸,利用Bayes逐步判别方法,建立尖孢镰刀菌寄主专化型判别模型。【结果】从供试的22个菌株中检测到8种脂肪酸,其中常见脂肪酸有6条,相对含量60%以上的主要脂肪酸有16:0、18:0和18:2 CIS 9,12/18:0a。对常见脂肪酸进行聚类分析,结果表明脂肪酸与尖孢镰刀菌寄主专化型的系统发育存在着对应关系。对常见脂肪酸进行主成分分析,得到尖孢镰刀菌脂肪酸中的特征脂肪酸有5个,分别为14:0(X1)、16:0(X2)、16:1 CIS 9(W7)(X3)、18:0(X4)和18:2 CIS 9,12/18:0a(X5)。利用Bayes逐步判别分析,建立的尖孢镰刀菌寄主专化型判别模型为Y1=-183.06+12.24X1+8.05X2+5.39X4+3.58X5、Y2=-174.09+10.40X1+7.96X2+5.40X4+3.42X5、Y3=-173.97+14.85X1+7.25X2+6.58X4+3.53X5,当1≤Yi<2时,菌株的寄主为西瓜;当2≤Yi<3时,菌株的寄主为香蕉;当Yi>3时,菌株的寄主为花生,且模型判对的概率为0.91。利用这套模型,对从西瓜、香蕉、花生上采集的56株尖孢镰刀菌寄主专化型进行判别,准确率达92.86%。【结论】脂肪酸生物标记可以作为尖孢镰刀菌寄主鉴别指标,脂肪酸14:0、16:0、18:0、18:2 CIS 9,12/18:0a是判别尖孢镰刀菌寄主的4个重要指标,建立的判别模型比较符合实际,有很好的应用价值。
分类号: S432.4
- 相关文献
[1]现代生物技术在根际微生物群落研究中的应用. 赵佳,孙毅,梁宏,黄静,杜建中. 2012
[2]利用拟杆菌分子标记物对粪便污染溯源的研究进展. 张曦,朱昌雄,朱红惠. 2011
[3]生命科学研究中的标记技术. 龙华,郑英,陈建武,张燕,余其兴. 2006
[4]三个棉蚜谷胱甘肽-S-转移酶(GST)基因克隆及在不同寄主专化型中的表达分析. 王传鹏,王传鹏,张帅,高雪珂,雒珺瑜,朱香镇,王丽,张开心,杨亦桦,崔金杰. 2020
[5]棉蚜唾液腺蛋白armet基因的克隆及表达特性分析. 任柯昱,张帅,雒珺瑜,吕丽敏,崔金杰,祝建波. 2018
[6]5个棉蚜组织蛋白酶B基因克隆及在不同寄主专化型中的表达分析. 刘伟娇,张肖丽,高雪珂,朱香镇,王丽,姬继超,雒珺瑜,崔金杰,李东阳,张开心. 2022
[7]不同专化型棉蚜对寄主的选择及其机制初探. 王丽,张帅,雒珺瑜,王春义,吕丽敏,张利娟,朱香镇,李春花,崔金杰. 2017
[8]棉蚜唾液蛋白C002基因克隆及在棉蚜不同寄主专化型中的表达分析. 任柯昱,张帅,雒珺瑜,王春义,吕丽敏,张利娟,朱香镇,王丽,崔金杰,祝建波. 2018
[9]安阳棉蚜寄主专化型及其形成机制初步分析. 张帅,雒珺瑜,吕丽敏,王春义,崔金杰. 2015
[10]高分辨四极杆飞行时间质谱仪判别复原乳和超高温灭菌乳. 崔婧,苏美丞,谭冬飞,张霞,贾曼. 2019
[11]偏最小二乘-判别分析模型影响因素初步研究. 王冬,王纪华,马智宏,李安,靳欣欣,潘立刚,侯金健,万赐晖. 2016
[12]基于计算机视觉技术的番茄叶部病害识别. 柴阿丽,李宝聚,石延霞,岑喆鑫,黄海洋,刘君. 2010
[13]基于机器视觉的烤烟鲜烟成熟度判别模型优选. 刘浩,孟令峰,王松峰,刘自畅,杜海娜,孙福山. 2023
[14]基于稳定同位素特征与土壤性质的有机茶身份辨识研究. 贾丽欣,双睿辰,邵金良,孟凡乔,吴迪. 2024
[15]基于二维光谱结合深度学习对不同产地杜仲的鉴别. 丁于刚,李鹂,左智天,李佑稷. 2023
[16]基于可见/近红外高光谱成像技术的梨树叶部病害识别研究. 潘健,祁雁楠,陈鲁威,夏烨,吕晓兰. 2024
[17]微生物发酵床猪舍环境气味电子鼻判别模型的研究. 蓝江林,刘波,陈峥,宋泽琼,林娟. 2012
[18]基于超微型地物光谱仪的稻田秧苗及稗草的早期识别. 王晓玉,李杰,张智优,李昱娇,杨情,杨玉,李亮,柏连阳. 2024
[19]苜蓿幼苗叶片过氧化物同工酶与根和根颈腐烂病抗病性的关系. 李敏权,张自和,马静芳,柴兆祥. 2003
[20]阿扎霉素F_(5a)抗南方根结线虫和香蕉枯萎病菌活性研究. 罗少娥,解修超,曾庆飞,雒丹丹,申张鹏. 2016
作者其他论文 更多>>
-
一株产纤维素酶菌株的筛选、鉴定及全基因组分析
作者:车建美;郑雪芳;王阶平;陈燕萍;陈冰星;刘波
关键词:纤维素酶;藤黄微球菌;生长特性;全基因组;纤维素降解基因
-
福建省多花黄精炭疽病的病原菌鉴定及防治药剂筛选
作者:程曦;史惠燕;杨益涵;牛雨晴;苏海兰;肖荣凤
关键词:多花黄精;炭疽病;病原菌鉴定;药剂筛选
-
甜味蛋白质基因工程与分子改性研究进展
作者:卢尚阳;常诗瑜;王语晴;刘波
关键词:甜味蛋白质;基因工程;异源表达;分子改性;甜味受体
-
淡水虾功能饲料的研发与产业应用(二)
作者:刘波
关键词:
-
淡水虾功能饲料的研发与产业应用(三)
作者:刘波
关键词:
-
TrKA、NGF基因多态性及其与德新肉用细毛羊产羔数关联分析
作者:李鹏飞;朱梦婷;哈尼克孜·吐拉甫;高杰;陶维昆;董桂花;闫娜娜;马锦晨;刘波;林长春;王许;王博;吴伟伟;齐·阿拉达尔
关键词:德新肉用细毛羊;TrKA基因;NGF基因;SNP;产羔数
-
抗病毒鲫鱼健康养殖及品质分析
作者:周群兰;潘良坤;刘波
关键词: