潘那利番茄GRF基因家族全基因组鉴定分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 戴麒

作者： 戴麒;徐瑞强;李宁;王柏柯;王娟;黄少勇;帕提古丽·艾斯木托拉;余庆辉

作者机构：

关键词： 潘那利番茄;GRF基因家族;全基因组分析;生物信息学

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2022 年 59 卷 010 期

页码： 2456-2465

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析研究潘那利番茄GRF基因家族全基因组鉴定分析.[方法]研究基于生物信息学方法对潘那利GRF基因家族成员进行全基因组鉴定和分析,并对其起源及进化进行了追溯.[结果]潘那利番茄中共鉴定了 10个SpGRF成员,不均匀分布在7条染色体上,预测了 SpGRFs蛋白的分子量、等电点、亲水性总均值等理化性质.SpGRFs基因可分为6个亚家族.所有SpGRF基因N端都含有1个QLQ和1个WRC结构域,C端则为多种保守基序.共线性结果显示基因组内有3对6个旁系同源基因,全部为片段复制,SpGRFs受自然选择压力下,有共同起源祖先,与拟南芥亲缘关系更近.[结论]鉴定了潘那利番茄中GRF基因家族的基本信息.

分类号： S641.2%S188

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