蓝舌病新疆分离株VP7蛋白编码基因序列分析及一步法RT-PCR方法的建立

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马晓菁

作者： 马晓菁;谷文喜;叶锋;刘帅;刘丽娅;谢彩云;钟旗;易新萍

作者机构：

关键词： 蓝舌病;VP7蛋白;RT-PCR

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 253-259

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】分析蓝舌病新疆分离株编码VP7蛋白S7基因保守序列，建立蓝舌病新疆分离株一步法RT-PCR方法，为新疆BTV分子流行病学调查及防控提供技术支持。【方法】采用二代测序技术获得新疆分离株S7基因序列，登陆GenBank对序列进行同源性Blast比对，用软件MEGA 5.0分析序列差异，根据蓝舌病新疆分离株编码VP7蛋白S7基因保守序列，运用软件Oligo6.0设计引物，对蓝舌病新疆分离株S7基因进行RT-PCR扩增，并验证该方法的特异性及敏感性。【结果】蓝舌病中国新疆分离株编码VP7蛋白S7基因序列与哈尔滨报道BTV分离株S7基因片段相似度较高为89.64%,与中国云南报道BTV-29型分离株、蒙古国BTV分离株S7基因片段相似度分别为87.49%和87.39%;与德国BTV分离株S7基因片段相似度为80.70%,其余均无同源性序列。中国新疆分离株S7基因片段序列与4条同源序列间存在26处核苷酸差异，9处氨基酸差异。【结论】建立的蓝舌病中国新疆分离株S7基因片段一步法RT-PCR方法具有良好的特异性，仅BTV中国新疆分离株扩增获得目的条带，该方法的敏感性为4.0×103 copies/mL。

分类号： S852.65

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