新城疫病毒F基因重要功能区和HN基因单核苷酸多态性研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张晓东

作者: 张晓东;刘怀然;刘培欣;刘胜旺;孔宪刚

作者机构:

关键词: 新城疫病毒;F基因;HN基因;单核苷酸多态性;选择压力

期刊名称: 中国家禽

ISSN: 1004-6364

年卷期: 2010 年 32 卷 16 期

页码: 14-17

收录情况: 北大核心

摘要: 对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion protein,F)基因47~435 nt区域进行了用单核苷酸多态性(SNP)分析。结果表明:在F基因47~435 nt间和HN基因中都存在高密度的SNP位点,Tajima′s D检验结果表明这些核苷酸变化符合中性突变假说,Pi(a)/Pi(s)分析暗示F蛋白编码基因N端的一些区段和HN蛋白编码基因中散在的部分区域受到了正向选择,但F基因和HN基因在整体上却都受到了强大的负向选择压力的影响。

分类号: S852.65

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