玉米HKT基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙博

作者： 孙博;张春宵;刘俊宇;焦仁海;董菁;吴松权;李晓辉

作者机构：

关键词： 玉米;HKT基因家族;生物信息学;盐碱胁迫;基因表达

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2024 年 32 卷 009 期

页码： 20-31

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于14个物种的HKT基因家族构建系统进化树，深入分析模式作物拟南芥及玉米、高粱、水稻3个亲缘关系较近的禾本科物种HKT家族成员的基因结构、保守基序及其蛋白质理化性质等，对玉米HKT基因家族进行全基因组鉴定和系统的生物信息学分析。分别用200 mmol/L NaCl和100 mmol/L Na2CO3对郑58(抗)和昌7-2(感)的玉米幼苗进行盐、碱胁迫处理，在胁迫0、1和3 d时取叶部及根部样品进行转录水平分析。结果表明，14个物种的HKT家族成员在系统进化树划分为两个支系，推测可能至少来自两个共同的祖先基因。HKT家族具有相似的基因结构和特殊的基因特征，玉米HKT基因家族中共有包括1个I型和两个II型在内的3个成员，推测拥有更多的HKT基因家族成员有助于植物在盐碱环境下获得更广泛的适应性。此外，盐碱处理下基因表达分析显示，郑58和昌7-2的耐盐碱性差异与ZmHKT1;1直接相关，与ZmHKT2;1间接相关，与ZmHKT1;2无关。

分类号： S513

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