应用特异PCR 快速鉴定微生物肥料中4种乳酸菌

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨小红

作者： 杨小红;曹凤明;关大伟;冯瑞华;陈慧君;李俊;沈德龙;马鸣超

作者机构：

关键词： 特异PCR;特异引物;乳酸菌;鉴定;微生物肥料

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2014 年 41 卷 4 期

页码： 674-680

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)、鼠李糖乳杆菌(L. rhamnosus)、嗜酸乳杆菌(L. acidophilus)和德氏乳杆菌(L. delbrueckii)是微生物肥料生产中常用的乳酸菌, 它们表型特征相似, 若采用传统方法鉴定则费时费力, 为准确、快速地鉴定这些种, 建立种特异PCR方法。【方法】利用NCBI 中Primer-BLAST (引物设计和特异性检验工具), 以GenBank 数据库中上述菌种的recA 和gyrB 为靶基因, 设计和筛选种特异性引物从而建立相应特异PCR 鉴定方法。【结果】经过乳杆菌属(Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus)、片球菌属(Pediococcus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、短芽孢杆菌属(Brevibacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas) 7个属24个种共40株标准菌株的实验验证, 4个目标种分别扩增出唯一的目的产物, 而其他种均无目的扩增产物。采用建立的4种特异PCR 方法对产品中分离的16株乳杆菌进行鉴定, 结果与16S rDNA 序列分析、Biolog 鉴定结果一致。【结论】建立的特异 PCR 鉴定方法均具有较高的种内通用性和种间特异性, 可快速、准确的用于微生物制剂中植物乳杆菌、德氏乳杆菌、鼠李糖乳杆菌、嗜酸乳杆菌的检测和鉴定, 具有较好的应用前景。

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