牛乳蛋白的遗传密码子使用频率分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘晶

作者： 刘晶;于浩;杨润军;鲍永华;李俊雅;戴蕴平;赵志辉

作者机构：

关键词： 牛乳蛋白;密码子使用频率;蛋白编码序列的密码子异质性;密码子偏爱性

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2011 年 31 卷 02 期

页码： 267-271

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 研究牛乳蛋白不同氨基酸的密码子使用频率对利用乳腺生物反应器表达目标蛋白过程中密码子的优化具有重要意义。本试验运用ENBOSS的CHIPS和SMS中的密码子使用工具对7种牛乳蛋白编码的基因进行了分析,并将这7个编码序列拼接在一起进行了乳蛋白全基因组的密码子偏爱性研究,同时与绵羊、猪及小鼠的乳蛋白密码子偏爱性进行了比较。结果表明:牛乳蛋白的CHIPS分析Nc值为51.867,αs1-CN、αs2-CN、-βCN、-κCN、α-LB、-βLG、LTF的Nc值分别为52.005、49.967、48.746、58.113、55.514、36.274、47.646,编码牛乳蛋白氨基酸的密码子出现频率较均一;牛乳蛋白V、A、R、I、T、L、Q、P等氨基酸的密码子使用频率与其他物种有较大差异。牛乳蛋白的密码子偏爱性与绵羊最为接近。

分类号： S823

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