水稻单核苷酸多态性及其应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘传光

作者： 刘传光;张桂权

作者机构：

关键词： 单核苷酸多态性;水稻;基因分型;遗传育种

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2006 年 28 卷 06 期

页码： 737-744

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)在水稻中数量多,分布密度高,最高SNPs数量可达80 127个,每154个碱基就存在一个SNP,平均SNP频率为0.65%左右。SNPs水稻亚种内品种间也很丰富,亲缘关系近的品种(或品系)间,即使用其他传统的分子标记方法难以找到多态性位点,用SNPs标记法也能找到数量可观的多态性位点。水稻SNP频率在各染色体间存在显著差异,而且在每条染色体上的分布也不均匀,存在明显的SNPs富集区域和稀缺区域。水稻SNPs的发现方法主要有对样本DNA的PCR产物直接测序、从SSR区段检测SNPs,以及从基因组序列和EST数据库直接搜索等。目前已有多种基因分型(genotyping)技术运用到了水稻SNPs检测,SNPs检测的高度自动化使水稻SNPs基因分型非常方便,SNPs检测还可以转化为CAPS(或dCAPS)标记或等位基因特异的PCR标记进行SNPs的基因分型。单核苷酸多态性在水稻遗传图谱的构建、基因克隆和功能基因组学研究、标记辅助选择育种、遗传资源分类及物种进化等方面的应用具有巨大潜力。

分类号： S511

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