北京地区侵染菊花的番茄斑萎病毒分子检测与基因组部分序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金凤媚

作者： 金凤媚;宋建;薛俊;陈东亮;王姝;张越;孙海波

作者机构：

关键词： 菊花;番茄斑萎病毒;分子检测;序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 175-184

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了确定北京菊花产区是否发生了番茄斑萎病毒病,了解该病毒北京分离物的序列变异情况,对该地区发生的TSWV进行了分子检测,并对该病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RDRP)、多糖蛋白(Gn-Gc)、运动蛋白(NSm)、外壳蛋白(N)、非结构蛋白(NSs)等5个基因进行了序列分析。结果表明,TSWV北京地区菊花分离物(Beijing-jh)的5个编码基因与国内各分离物的进化关系较远,与来自韩国和西班牙的分离物亲缘关系较近。相似性分析表明,N基因是最为保守的基因,核酸平均相似性为97.2%,蛋白为98.6%,RDRP的变异性最大,核酸平均相似性为95.4%,蛋白为96.8%,且Beijing-jh分离物的5个基因编码的氨基酸与来自西班牙分离物的相似性最大,初步表明,该分离物可能是由于贸易活动由国外传入我国。

分类号： S436.8

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