白桦漆酶BpLAC1基因生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 冯连荣

作者： 冯连荣;宋立志;赵大根;王玉成;池玉杰

作者机构：

关键词： 白桦;漆酶;LAC1基因;生物信息学分析

期刊名称： 南方林业科学

ISSN： 2095-9818

年卷期： 2017 年 45 卷 03 期

页码： 19-22

摘要： 为了深入了解白桦漆酶BpLAC1基因的功能,利用生物信息学方法对其结构域及功能进行预测,包括开放阅读框分析、信号肽预测、基本理化性质分析、糖基化位点预测、保守结构域分析、系统进化分析、蛋白质二级及三级结构预测。结果如下:BpLAC1基因序列全长为1 677 bp,开放阅读框ORF长为1 677 bp,编码558个氨基酸,蛋白相对分子量为58.6 k Da,理论等电点为9.53,是稳定的亲水蛋白;具有2个糖基化位点和13个磷酸化位点;该蛋白含有一个信号肽,属于分泌型蛋白;含有3个Cu-oxidase保守区,属于Cupredoxin superfamily家族;系统发育树分析表明,BpLAC1蛋白与川桑亲缘关系较近,与柑橘属Citrus、鹰嘴豆属Cicer等亲缘关系相差较远。二级结构中α-螺旋占14.04%,β-转角占11.99%,不规则卷曲链39.51%,延伸链占据34.46%。

分类号： S792.153

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