基于GBS技术的铁皮石斛种质群体遗传结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 付曼曼

作者： 付曼曼;吴超;丁晓瑜;林森洪;黎侠;郭方其

作者机构：

关键词： 铁皮石斛;GBS;SNP;系统进化树;群体遗传结构

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 023 期

页码： 7950-7959

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 铁皮石斛是中国传统的名贵中药材，具有抗氧化、抗衰老、增强免疫力等功效。本研究旨在通过GBS技术探讨不同省份来源的铁皮石斛的群体遗传结构。以59份来自不同省份的铁皮石斛为材料提取DNA，构建文库，库检合格后上机测序，测序数据质量合格后进行酶切，然后基于石斛参考基因组进行单核苷酸多态性检测，分析其进化树、主成分及遗传结构。从59份铁皮石斛样本中获得有效数据51.442 G，高质量SNP位点为69 943个，进化树分析结果显示59份不同省份来源的铁皮石斛可被分为3组，来自云南的品种与浙江的品种亲缘关系较近，主成分分析和群体遗传结构分析结果与进化树结果相一致。本研究结果可为铁皮石斛种质资源的收集和保护提供依据，为挖掘优良种质及培育优良品种提供资源。

分类号： S567.239

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