猪hnRNPUL1基因克隆及变异剪接体鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋艳芳

作者： 宋艳芳;张彩霞;杜芳芳;马骏杰;刘东宇;刘娣;杨秀芹

作者机构：

关键词： 猪;hnRNPUL1;克隆;变异剪接体

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2020 年 03 期

页码： 443-451

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在克隆民猪hnRNPUL1基因全长编码区(complete coding sequence, CDS)序列并进行可变剪接分析,研究其组织表达和亚细胞定位情况。本研究以3头3月龄民猪为试验材料,利用RT-PCR技术克隆hnRNPUL1基因CDS及可变剪接体,应用qRT-PCR检测其在心、肝、脾、肺、肾、胃、大肠、小肠、背肌、腿肌等组织中的表达情况,同时,在生物信息学预测的基础上,通过融合表达绿色荧光蛋白的方法鉴定核定位序列。研究结果表明,猪hnRNPUL1基因(GenBank accession No.:MN399154) CDS全长2 580 bp,预期编码的多肽链存在着hnRNPs家族的特征性结构域——SAP、SPRY和AAA;猪hnRNPUL1普遍表达于所检测的各组织中,其中在脾脏中表达量最高,在腿肌中表达量最低;核定位序列(NLS)位于多肽链的133～430 aa处,与生物学信息学预测的结果存在着偏差;同时获得了2个变异剪接体和11种可变剪接片段。本研究结果对进一步揭示猪hnRNPUL1基因功能及转录调控机制提供了基础。

分类号： S828.2

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