苹果α-法尼烯合酶基因组结构和序列的多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苑克俊

作者： 苑克俊;刘庆忠;李勃;张力思

作者机构：

关键词： 苹果;α-法尼烯合酶;基因组DNA;多态性;虎皮病

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2007 年 34 卷 04 期

页码： 1003-1006

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过设计引物进行PCR扩增、测序、拼接序列,以及与GenBank中的cDNA序列(登录号AY182241)进行比对,获得α-法尼烯合酶基因(AFS)的基因组序列和内含子/外显子结构。获得的AFS基因序列已在GenBank注册(登录号DQ901739),它有6个内含子和7个外显子,编码一个大小为576个氨基酸的蛋白质。间隔外显子的6个内含子相位分别是0、1、2、2、0、0,其大小分别是108、113、>1000、125、220和88bp,7个外显子的推导氨基酸序列大小分别是57、89、127、73、48、83和99。编码的蛋白质中有3个序列模式(motif),RR(X8)W模式的编码基因序列在基因5′端的外显子1上,RxR模式和DDxxD模式的编码基因序列在外显子4上。将获得的AFS基因序列与GenBank中的cDNA序列(登录号AY523409)进行比对,结果发现两序列间有6个单核苷酸多态性,其中4个引起氨基酸突变。有意义的是,1个氨基酸突变(291R→G)发生在RxR模式上,此氨基酸突变以及其它突变是否与苹果α-法尼烯合成能力和虎皮病发生能力有关,值得进一步探讨。

分类号： S661.1

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