海绵Pachychalina sp.体内古菌多样性非培养技术分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 方再光

作者： 方再光;黄惠琴;张开山;潘志强;鲍时翔

作者机构：

关键词： 海绵Pachychalina sp.;16SrDNA;ARDRA;古菌多样性

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 1005-7021

年卷期： 2005 年 45 卷 01 期

页码： 121-124

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用非分离培养分析方法 ,即 16SrDNA限制性酶切片段长度多态性 (ARDRA)和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalinasp .体内的古菌多样性进行了研究。从海绵体内直接提取古菌总DNA。以样品总DNA为模板 ,用古菌 16SrDNA通用引物进行PCR扩增获得 16SrDNA ,回收、纯化 16SrDNA产物并克隆到T Vector。进行第二次PCR扩增反应 ,且对扩增产物进行ARDRA。在古菌 16SrDNA的ARDRA图谱中 ,大多数克隆的酶切带谱上存在差异 ;随机挑选 8个克隆子进行测序 ,获得古菌 16SrDNA的部分序列 ,并对 16SrDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树 ,结果发现海绵体内的古菌主要属于Methanogeniumorganophilum、Methanoplanuspetrolearius等古菌类。但它们与目前数据库中收录的古细菌间的相似性均不超过 90 % ,它们极有可能是一些新的古菌

分类号： Q931

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