一个新的葡萄抗逆转录因子VvERF2基因的In silico克隆及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘红锦
作者: 高峰;熊爱生;彭日荷;李贤;蔡斌;薛永;付晓燕
作者机构:
关键词: ERF;In silico克隆;葡萄;转录因子;生物信息学
期刊名称: 上海农业学报
ISSN: 1000-3924
年卷期: 2008 年 24 卷 03 期
页码: 16-21
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: ERF是植物所特有的一类重要的转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导。本研究利用In silico克隆方法获得葡萄VvERF2基因,并利用生物信息学方法对该基因编码产物从氨基酸组成、理化性质、进化关系、二级及三级结构、功能等方面进行预测和分析。结果表明,VvERF2为亲水性蛋白,与其他物种的ERF在序列组成、结构及活性位点等方面均具有高度的一致性。
分类号: S663.1
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