芹菜和细叶旱芹叶绿体基因组结构特征与系统进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杜佳庚

作者： 杜佳庚;李晓燕;李威龙;谭国飞;熊爱生;李梦瑶

作者机构：

关键词： 芹菜;细叶旱芹;叶绿体基因组;结构特征;进化

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2024 年 60 卷 003 期

页码： 471-482

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 芹菜(Apium graveolens)和细叶旱芹(Apium leptophyllum)同为伞形科草本植物,二者均富含丰富的营养元素并具有较高的药用价值.利用Illumina NovaSeq 6000和Nanopore测序平台对芹菜和细叶旱芹的叶绿体基因组进行测序,通过组装和注释获得完整叶绿体基因组序列,并将其序列特征与伞形科其他物种进行差异比较.结果表明,芹菜和细叶旱芹叶绿体基因组全长分别为152 025和158 702 bp,分别包含87和94个蛋白质编码基因,都具有8个rRNA基因和37个tRNA基因.芹菜和细叶旱芹重复序列的类型与分布模式相似,但数目略有差异,芹菜叶绿体基因组中鉴定到202个SSRs,低于细叶旱芹中的219个.与大多数被子植物一样,芹菜和细叶旱芹均偏好使用A/T结尾的密码子;核酸多样性分析显示,二者叶绿体基因组SSC区域中rpl32基因可作为潜在的分子标记用以鉴定伞形科物种.比较基因组学分析结果表明,伞形科植物叶绿体全基因组大小、结构、基因组成和排列顺序等在种内及种间均高度保守,均未检测出大片段的基因重排,呈现出高度共线性关系.基于20种伞形科植物的叶绿体基因组序列构建系统进化树,揭示了芹菜和细叶旱芹物种之间高度相似.本研究为芹菜和细叶旱芹叶绿体基因组提供了全面的信息,有助于今后更全面的了解伞形科植物叶绿体基因组的特征与进化.

分类号： S636.3

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