用3′RACE方法扩增并克隆口蹄疫病毒基因组3′末端序列

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘光清

作者： 刘光清;刘在新;谢庆阁

作者机构：

关键词： 3′RACE;口蹄疫病毒;3′端非编码区;Poly(A);序列分析

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2003 年 23 卷 06 期

页码： 524-526

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用 3′RACE方法扩增并克隆了口蹄疫病毒 ( FMDV) OH99株基因组 3′端真实序列。测序结果表明 ,所扩增的目的基因片段长 15 0 0 nt,包括 3D基因部分序列、3′端非编码区 ( Non- Coding Region,NCR)和 Poly( A)尾巴 ,其中 3′NCR位于终止密码子 TAA之后 ,长 93nt,Poly( A)尾序列至少含有 5 6个 A。与参考毒株进行序列比较 ,结果显示 ,OH99株与 OTY TW/ 97株的核苷酸同源性较高 ,为 91.4 % ,而与 O1K、CHINA99、A12等毒株的核苷酸同源性较低 ,其同源性分别为 6 8.1%、71.0 %、70 .2 %。 3′NCR的末端存在保守性较高的基序 :CCCTCAGATG,TTTTCCC-CGCTTCCT。本研究为进一步研究 FMDV基因组的功能、构建 OH99株的反向遗传操作系统奠定了基础。

分类号： S852.65

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