菘蓝4-香豆酸:辅酶A连接酶全基因家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张苛苛

作者： 张苛苛;谭宇萍;徐欢欢;孙术富;肖建才;徐朝阳;王晨晨;朱哈修;杨健;李大勇;唐金富

作者机构：

关键词： 4-香豆酸:辅酶A连接酶;菘蓝;生物信息学分析;类黄酮

期刊名称： 中国中药杂志

ISSN： 1001-5302

年卷期： 2024 年 49 卷 002 期

页码： 361-369

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)是植物中类黄酮、可溶性酚酯、木脂素和木质素等苯丙烷类化合物上游途径的关键酶.该研究基于菘蓝基因组数据库,以拟南芥Arabidopsis thaliana的 13 个 4CL家族成员为参考序列,获取菘蓝 4CL基因家族的候选成员,并进行生物信息学分析、4CL基因表达模式及类黄酮代谢成分积累模式等研究.结果共获得 13 条菘蓝 4CL基因家族成员,分别命名为Ii4CL1~Ii4CL13,分别定位到 1、2、3、4、6 号染色体上.基因结构与保守结构域分析发现菘蓝 4CL基因家族成员的内含子数目为 1~12,蛋白结构域具有高度保守性.顺式作用元件分析表明在菘蓝 4CL基因家族成员启动子序列中存在多个响应元件,其中茉莉酸反应元件数量最多.共线性分析表明菘蓝 4CL基因家族成员与同科植物拟南芥之间存在更近的亲缘关系.qPCR结果显示,菘蓝 4CL基因家族表达分析发现 10 个 4CL基因在菘蓝的地上部分相对表达量更高.对菘蓝不同部位类黄酮化合物的含量进行检测,发现菘蓝的类黄酮主要积累在地上部分.该研究为深入探索菘蓝 4CL基因家族成员参与菘蓝类黄酮生物合成的分子机制奠定了基础.

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