灰枣扩展蛋白基因ZjEXPA8的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 靳娟

作者： 靳娟;苏比娜·肖克来提;阿布都卡尤木·阿依麦提;杨磊;郝庆;樊丁宇

作者机构：

关键词： 灰枣;ZjEXPA8;基因克隆;序列分析

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2023 年 60 卷 009 期

页码： 2223-2230

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]克隆灰枣扩展蛋白基因ZjEXPA8,分析其序列特征,为研究该基因在灰枣果实发育过程中的作用和功能奠定基础.[方法]以不同发育形态的灰枣花和幼果为试材,根据灰枣 ZjEXPA8 基因(LOC107414006)序列,应用Primer Premier 5.0 软件设计引物,RT-PCR技术克隆ZjEXPA8 基因,利用生物信息学方法分析 ZjEXPA8 核苷酸序列.[结果]ZjEXPA8 基因的开放阅读框为 762 bp(基因登录号为 NP_001310794.1),编码253 个氨基酸,预测蛋白分子量为 26.91 kDa,等电点为 8.32,不稳定系数为 30.09,脂肪指数为66.72,总亲水性平均数为-0.107,属于稳定亲水蛋白.ZjEXPA8 蛋白主要含有无规则卷曲.ZjEX-PA8 蛋白的不具有跨膜结构域,含有DPBB_1 和Pollen_allerg_1 两个保守结构域.ZjEXPA8 蛋白与大豆(Gly-cine max,XP_003523276.1,GmEXPA8)的相似性最高,为93.13%.ZjEXPA8 基因与橡胶(Hevea brasiliensis,XP_021684783.1,HbEXPA8)和拟南芥(Arabidopsis thaliana,NP_181593.1,AtEXPA8)的亲缘关系最近.灰枣ZjEXPA8 基因在枣花发育不同时期均有表达,蕾黄期表达量最高,萼片展平期次之,该基因可能主要在蕾黄期和萼片展平期发挥作用.[结论]ZjEXPA8 基因编码的蛋白与大豆的同源性最高.系统进化树分析发现灰枣ZjEXPA8 与橡胶HbEXPA8 和拟南芥AtEXPA8 亲缘关系较近.ZjEXPA8 基因在灰枣花蕾黄期表达量最高.

分类号： S665.1

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