中国对虾甘氨酸脱羧酶的基因克隆、表达及其与抗WSSV的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 史晓丽

作者： 史晓丽;张莹雪;孟宪红;孔杰;栾生;罗坤;曹宝祥;曹家旺;陈宝龙

作者机构：

关键词： 中国对虾;甘氨酸脱羧酶;基因克隆;表达;关联分析

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2019 年 40 卷 02 期

页码： 74-82

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究采用RACE技术克隆获得中国对虾(Fenneropenaeuschinensis)甘氨酸脱羧酶基因(Fc GLDC)的全长cDNA及DNA序列,并对其进行生物信息学分析。结果显示,FcGLDC基因的cDNA全长为3481 bp,其中,ORF为2829 bp,5￠UTR长17 bp,3￠UTR长86 bp。完整的阅读框编码942个氨基酸,分子量为104.66 kDa,预测的理论等电点为6.51。FcGLDC基因DNA序列全长共4964bp,包含12个外显子和11个内含子。同源性及系统进化分析显示,FcGLDC基因与节肢动物的GLDC基因聚为一类;氨基酸序列比对发现,Fc GLDC基因的蛋白序列与节肢动物的相似度最高,与内华达白蚁(Zootermopsis nevadensis)、体虱(Pediculus humanus corporis)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)的相似度分别为71%、68%和68%。在鳃、肝胰腺和肌肉中的荧光定量PCR结果显示,FcGLDC在肌肉中的相对表达量最高,鳃中最低。WSSV感染后,该基因在鳃、肝胰腺和肌肉中呈现出了不同的时空表达特点。使用直接测序法结合质谱法,在该基因内部发现4个SNP位点,但是各位点与抗WSSV性状均不相关(P>0.05)。本研究表明,FcGLDC基因在对虾感染WSSV后的应答反应中或起一定作用。

分类号： S945.4

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