大丽轮枝菌(VerticilliumdahliaeVdLs.17)分泌组预测及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田李

作者： 田李;陈捷胤;陈相永;汪佳妮;戴小枫

作者机构：

关键词： 大丽轮枝菌;分泌蛋白;信号肽;碳水化合物活性酶;激发子

期刊名称： 中国农业科学

ISSN：

年卷期： 2011 年 15 期

页码： 3142-3153

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】预测并分析大丽轮枝菌基因组范围内的分泌蛋白,为大丽轮枝菌分泌蛋白致病机理的研究奠定基础。【方法】利用已公布的大丽轮枝菌全基因组序列,组合使用生物信息学软件SignalP、TargetP、TMHMM、Big-pi和PROSITE,预测大丽轮枝菌基因组范围内所有分泌蛋白,定义为分泌组。统计分析分泌组中蛋白N-端信号肽特点;应用碳水化合物活性酶类数据库和病原菌-寄主互作蛋白数据库对分泌组蛋白进行注释,预测分泌组中潜在果胶酶、纤维素酶和病原菌寄主互作蛋白;利用真菌激发子的保守结构域,预测分泌组中潜在的激发子蛋白集;应用BLASTP程序比较分析大丽轮枝菌和黑白轮枝菌分泌组,获得大丽轮枝菌相对于黑...

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