基于流式细胞术和K-mer方法测定6种槭属植物基因组大小

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马秋月

作者： 马秋月;王玉虓;李倩中;李淑顺;闻婧;朱璐;颜坤元;杜一鸣;解志军;李淑娴;欧阳芳群;鲁成代

作者机构：

关键词： 械属;基因组大小;流式细胞术;K-mer分析

期刊名称： 南京林业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-2006

年卷期： 2023 年 47 卷 001 期

页码： 163-170

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]械属植物种类繁多,具有观赏、油用、药用等重要价值,开发应用前景广阔.基于流式细胞术和K-mer分析方法,首次进行6种槭树基因组大小测定,为械属植物分子生物学、细胞学研究提供重要理论参考.[方法]以6种械树嫩叶为材料,WPB为细胞核解离液,大豆(Glycine max'Polanka')和玉米(Zea mays CE-777)为内标,利用流式细胞检测技术和K-mer分析法估测6种槭树的基因组大小.[结果]基于流式细胞术测定建始槭(Acer henryi)、三角枫(A.buergerianum)、秀丽槭(A..elegantulum)、血皮槭(A.griseum)、五小叶槭(A.pentaphyl-lum)和青楷槭(A.tegmentosum)的基因组大小分别为(691.12±8.69)、(863.90±8.69)、(896.50±4.35)、(893.24±8.69)、(766.10±8.69)和(1 154.04±13.04)Mb;以 K-mer 分析法估测的基因组大小分别为 561.72、743.00、777.87、771.51、650.64和1 103.46 Mb;杂合率分别为1.00%、1.24%、1.31%、1.08%、0.28%、0.81%.K-mer分析法估测的基因组大小略小于流式细胞术预测结果.[结论]本研究的结果可丰富槭属植物基因信息库,也可为该属植物基因组学、分子细胞遗传学等研究奠定重要基础.

分类号： S687.9%S722

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