基于SNP分子标记构建黄瓜指纹图谱

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王欣

作者： 王欣;张鹏;朱育强;孙玉燕;董文其;周胜军

作者机构：

关键词： 黄瓜(Cucumis sativus L.);SNP分子标记;遗传多样性分析;DNA指纹图谱

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 021 期

页码： 7054-7066

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 黄瓜是全世界栽培最广、生产和消费最多的蔬菜作物之一，具有较高的经济价值。为了加强黄瓜种质资源的保护与利用，本试验利用259份黄瓜材料的重测序数据进行SNP鉴定，根据位点缺失率、杂合度以及多态性信息含量等指标对SNP集合进行筛选，最终获得了能够高效鉴定黄瓜种质的150个核心SNP标记。该套核心SNP位点组合的PIC和MAF平均值分别为0.374、0.479。通过聚类分析可知，259份黄瓜种质可以被划分为东亚型和欧亚型两大类群。基于以上核心SNP标记为每一份黄瓜种质构建了DNA指纹图谱，能够有效区分所有供试材料。本研究为黄瓜遗传多样性分析、种质资源鉴定以及新品种培育提供了重要的理论依据。

分类号： S642.2

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