白羽绿头鸭骨骼肌发育内参基因的鉴定和筛选
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵明明
作者: 赵明明;刘博;吴琼;赵家平;涂剑锋
作者机构:
关键词: 白羽绿头鸭;内参基因;骨骼肌发育;稳定性;筛选
期刊名称: 黑龙江畜牧兽医
ISSN: 1004-7034
年卷期: 2021 年 023 期
页码: 122-129
收录情况: 北大核心
摘要: 为选取适宜进行白羽绿头鸭骨骼肌发育相关基因研究的内参基因,试验通过实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)对13个候选内参基因进行表达稳定性验证,利用geNorm、NormFinder软件评估候选内参基因稳定性,利用BestKeeper软件对geNorm和NormFinder软件评估结果中稳定性排前10位的候选内参基因进行稳定性分析,用RefFinder软件对内参基因稳定性进行综合评价,并通过geNorm软件确定最适内参基因数量。结果表明:geNorm软件评估结果显示SEC61G与NDUFB3组合内参基因稳定性最高,HPRT1基因稳定性最低,最适内参基因数为2个;NormFinder软件评估结果显示NDUFB3稳定性最高,HPRT1基因稳定性最低;BestKeeper软件评估结果显示SAT1稳定性最高,GAPDH基因稳定性最低;Refinder软件评估结果显示候选内参基因稳定性从高到低依次为NDUFB3>SEC61G>SOD1>SAT1>TOP2B>ATP5MF>HMBS>HINT1>GAPDH>YWHAZ>RPS2>ACTB>HPRT1,HPRT1的表达最不稳定,NDUFB3基因表达最稳定。说明在白羽绿头鸭骨骼肌发育中,最佳内参基因为NDUFB3,最佳内参基因组合为NDUFB3和SEC61G,2个内参基因最佳。
分类号: S834.2
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