牦牛Akirin1基因克隆、生物信息学及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马荣

作者： 马荣;路建卫;赵雪;扎老;成述儒;喇永福;吴晓云;包鹏甲;郭宪;梁春年

作者机构：

关键词： 牦牛;Akirin1基因;克隆;生物信息学分析;组织表达分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2024 年 39 卷 0S1 期

页码： 267-273

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究牦牛Akirin1基因的序列特征，详细了解其组织表达特性。以甘南牦牛肌肉组织cDNA为模板，利用RT-PCR技术克隆甘南牦牛Akirin1基因CDS序列，并使用多种生物在线软件及工具进行生物信息学分析，再利用qPCR技术检测Akirin1基因在甘南牦牛心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和睾丸组织中表达差异。结果显示，甘南牦牛Akirin1基因CDS长579 bp,共编码192个氨基酸，基因编码的蛋白分子式为C964H1525N275O291S8,蛋白理论等电点为8.91,不稳定系数和总平均亲水性分别为84.14,-0.822,属于不稳定亲水性蛋白；蛋白潜在磷酸化位点有29个，分别为14个丝氨酸，11个苏氨酸和4个酪氨酸；无信号肽和跨膜螺旋结构，亚细胞定位显示，主要存在于细胞核中，属于非分泌型蛋白；蛋白高级结构主要由39.06%的α-螺旋和56.25%的无规则卷曲结构组成。同源性分析比对牦牛与普通牛亲缘关系最近，符合实际情况，说明Akirin1基因在进化过程中相对具有一定保守性。实时荧光定量结果显示，Akirin1基因在成年甘南牦牛心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪组织均有所表达，而在肾脏组织中相对表达最多，显著高于其他组织，在肌肉和肝脏组织中表达相对较少。本试验为进一步研究牦牛Akirin1基因功能特征提供一定的理论基础。

分类号： S823.85

  • 相关文献

[1]牦牛CTGF基因克隆、蛋白功能及组织表达分析. 陈美,柴志欣,武志娟,王吉坤,钟金城,信金伟. 2021

[2]牦牛Agouti基因的克隆及编码区多态性研究. 张建一,梁春年,吴晓云,张良斌,郭宪,裴杰,阎萍. 2014

[3]牦牛MDHI基因的克隆及组织表达分析. 陈露露,王会,柴志欣,钟金城,王吉坤,陈智华,姬秋梅,信金伟. 2019

[4]牦牛VEGF-A基因的克隆及生物信息学分析. 吴晓云,阎萍,梁春年,郭宪,包鹏甲,裴杰,褚敏,丁学智,刘文博,焦斐,刘建. 2012

[5]牦牛和犏牛Dmrt7基因序列分析及其在睾丸组织中的表达水平. 金帅,郭宪,包鹏甲,梁春年,吴晓云,刘建,阎萍. 2013

[6]牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析. 秦文,阎萍,裴杰,吴晓云,李天科. 2013

[7]牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析. 金帅,齐社宁,阎萍,梁春年,郭宪,包鹏甲,裴杰,褚敏,丁学智,刘文博,吴晓云,刘建. 2012

[8]牦牛MITF-M基因序列分析及其在皮肤组织中表达水平. 张建一,梁春年,裴杰,郭宪,沈友明,阎萍. 2015

[9]牦牛CAPN3基因的克隆及组织表达特异性. 王英杰,阎萍,潘和平,吴晓云,李明霞. 2016

[10]大通牦牛ApoA1基因克隆及生物信息学分析与组织表达谱分析. 王福彬,吴晓云,顾亚荣,郑青波,马晓明,褚敏,阎萍,潘和平. 2022

[11]牦牛Myf6基因克隆及生物信息学分析. 雷秦祎,付东海,常永芳,吴晓云,梁春年,褚敏,阎萍. 2019

[12]绵羊TMEM182基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析. 刘璇,李婧平,马海叶,张倩雯,王嘉俊,李忠慧,李文蓉. 2024

[13]西藏牦牛ELOVL6基因的克隆、生物信息学及组织表达量分析. 任稳稳,郑青波,黄纯,王兴东,阎萍,梁春年. 2022

[14]类乌齐牦牛UCP3基因克隆与序列分析. 季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,钟金城. 2019

[15]牦牛RETN基因克隆及组织表达分析. 侯孟典,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[16]类乌齐牦牛EGLN1基因克隆、生物信息学分析及差异表达. 管春燕,王吉坤,柴志欣,王会,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[17]牦牛HYOU1基因克隆及组织表达分析. 季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,钟金城. 2019

[18]牦牛ATP6和ATP8基因生物信息学分析. 吴晓云,阎萍,梁春年,郭宪. 2011

[19]牦牛SCD基因的克隆和生物信息学分析. 付东海,吴晓云,王宏博,褚敏,郭宪,裴杰,包鹏甲,丁学智,阎萍,梁春年. 2018

[20]牦牛CST3基因的克隆、表达及生物信息学分析. 李春海,陈晓英,王红梅,杨刘玥玲,赵旺生. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序