清远麻鸡miR-142-3p分析及其关键靶基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱师良

作者： 朱师良;余春林;邱莫寒;张增荣;熊霞;胡陈明;杨礼;彭涵;陈家磊;宋小燕;夏波;杨朝武

作者机构：

关键词： 清远麻鸡;miR-142-3p;生物信息学;组织表达;脾脏

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2024 年 29 卷 007 期

页码： 12-22

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析清远麻鸡不同组织中miR-142-3p的表达情况,并筛选其在脾脏中的关键靶基因,本研究利用在线数据库预测鸡miR-142-3p靶基因,并对靶基因进行GO和KEGG富集分析以及构建蛋白-蛋白互作网络.利用在线公共数据库,分析脾脏相对于其他组织的miR-142-3p表达量;再根据miRNA表达量与其靶基因表达量负相关机制,对miR-142-3p靶基因与脾脏中相对其他组织显著下调基因取交集,筛选潜在靶基因.结果表明:1)预测获得85个靶基因,GO富集分析显示,靶基因参与多种高分子化合物的合成与转运过程.2)KEGG结果显示富集到MAPK、Notch、Wnt等多条与抗肿瘤免疫相关的信号通路.3)PPI网络共筛选到4个Hub基因.4)miR-142-3p在脾脏中的表达量极显著高于肝脏、肺脏、胸肌、心脏和肾脏(P<0.01).5)共筛选到TWF1、MYH10、NFIB、FNBP1L和FERMT2 5个靶基因.综上,鸡miR-142-3p在脾脏中很可能通过TWF1、MYH10、NFIB、FNBP1L和FERMT2发挥生物学功能.本研究为解析鸡miR-142-3p的功能及其分子机制提供了参考和依据.

分类号： S831.2

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