番鸭细小病毒NS和VP基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 戴银

作者： 戴银;胡晓苗;赵瑞宏;张丹俊;潘孝成;沈学怀;尹磊;周学利;侯宏艳

作者机构： 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 番鸭细小病毒;NS基因;VP基因;序列分析

期刊名称： 中国兽医杂志

ISSN： 0529-6005

年卷期： 2022 年 58 卷 001 期

页码： 37-42

收录情况： 北大核心

摘要： 为进一步了解番鸭细小病毒(MDPV)基因的遗传变异特征,本试验采用分段PCR扩增法获得了2个MDPV安徽分离株(AH1901和AH1902)基因组NS和VP全长基因,并与GenBank数据库中的20个水禽细小病毒基因组序列进行了比对.序列分析显示,克隆的MDPV基因均包括完整的NS和VP基因,分别为1 884 bp和2 199 bp,VP基因核苷酸序列变异程度相对较高,而NS基因则较为保守;进化分析显示,安徽分离株AH1901和AH1902位于同一分支,二者与国内分离的MDPV毒株ZJ-JH-2013基因遗传距离最近,可能来源于同一毒株,与MDPV疫苗株P1及国外分离毒株FM基因遗传距离则较远;安徽分离株AH1901和AH1902的NS基因序列同源性为99.8%,VP基因序列一致.两者的NS、VP基因序列与分离株ZJ-JH-2013的同源性最高,与重组型毒株SAAS-SHNH及安徽分离株AH 1401同源性也在99.5%以上;与疫苗株P1、国外分离株FM同源性则较低,其中VP基因仅为88.9%、89.3%.本试验结果表明近年国内的MDPV分离株同源性均较高,但仍存在一定程度的基因变异,增加了诊断与防控该病的难度.

分类号： S852.65+9.2

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