大口黑鲈微卫星多重PCR体系及3个群体的遗传分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 傅建军

作者： 傅建军;龚雅婷;朱文彬;强俊;张林兵;王兰梅;罗明坤;董在杰

作者机构：

关键词： 微卫星;多重PCR;遗传分析;大口黑鲈

期刊名称： 水生生物学报

ISSN： 1000-3207

年卷期： 2023 年 47 卷 009 期

页码： 1514-1522

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为开展大口黑鲈(Micropterus salmoides)种质评估和遗传分析提供便捷的研究手段,试验筛选了扩增效果好、具有多态性的18个微卫星位点,构建了6组3重PCR体系.随后将多重PCR体系应用于大口黑鲈3个群体(美国群体USA、"优鲈1号"YLO和杂交子代HYB)的遗传分析.结果显示,各位点的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态性信息含量(PIC)分别介于3-14、1.622-5.841、0.333-0.806、0.385-0.833和0.361-0.810,其均值分别为7.722、3.056、0.577、0.626和0.579.剔除2个偏离Hardy-Weinberg平衡位点的分析显示,YLO的遗传多样性水平最低,HYB的平均观测杂合度最高(Ho= 0.743),其余多态性指标均在USA中呈现最高值.USA与YLO间的Nei's遗传距离最远(0.362),HYB与USA和YLO间的Nei's遗传距离分别为0.112和0.179.两两群体间均存在极显著的遗传分化(P<0.01),其中USA与YLO间遗传分化水平最高(FST=0.209).基于等位基因频率的遗传结构分析结果显示,USA和YLO具有相对独立的遗传结构,而HYB呈现出不同的遗传来源.主成分判别分析的散点图显示,不同群体来源的个体能获得较有效区分,HYB分布介于USA和YLO的区域之间.研究表明,试验构建的微卫星多重PCR体系,涉及位点具有较高多态性,并能有效应用于大口黑鲈的群体遗传分析,可为其遗传育种研究提供技术支持.

分类号： S917.4

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