基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制
文献类型: 中文期刊
第一作者: 唐鑫鑫
作者: 唐鑫鑫;郑炬梅;骆娜;营凡;朱丹;李森;刘大伟;安炳星;文杰;赵桂苹;李和刚
作者机构:
关键词: 白羽肉鸡;腿病;全基因组关联分析;候选基因
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2024 年 55 卷 001 期
页码: 99-109
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 旨在揭示肉鸡腿病发生的遗传机制以降低肉鸡腿病发生率.采用我国自主培育的"广明2号"多品系、多世代共2 331只白羽肉鸡公鸡作为试验素材,于42日龄通过X光鉴定腿部健康状况,利用"京芯一号"55K SNP芯片对全部个体进行基因分型,使用plink运用二分类性状的逻辑回归模型(logistic regression model,LR Model)对腿部健康表型进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GW AS).将不同群体芯片数据合并进行质控后,保留2 330个个体(2 256只健康,74只患病)和30 414个SNPs位点用于后续分析.通过GW AS分析筛选到5个潜在SNPs位点,分布在6号和18号染色体上,分别注释到与腿病相关的3个功能候选基因TBCD、SIRT1和PBLD上.本研究为白羽肉鸡腿部健康表型提供了重要的遗传位点和候选基因,为推进肉鸡抗病育种进程提供遗传基础.
分类号: S831.2
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