番茄泛素结合酶变体基因鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵秋芳

作者： 赵秋芳;马海洋;马智玲;魏长宾;陈曙

作者机构：

关键词： 番茄;泛素结合酶变体;非生物胁迫;基因表达

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2022 年 35 卷 006 期

页码： 1274-1281

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]开展番茄泛素结合酶变体(UEV)家族基因鉴定、组织特异性和非生物胁迫表达模式分析,为阐明UEV基因在番茄生长和逆境响应中的功能研究奠定基础.[方法]利用已知拟南芥UEV家族基因为探针,在番茄基因组数据库中查找并下载番茄UEV基因序列,同时查找其CDS、氨基酸长度及染色体位置等信息.利用生物信息学方法,通过在线工具GSDS 2.0、Expasy-prot-param、Plant-PLoc、MEME对获得序列的基因结构、蛋白质分子量、等电点、亚细胞定位、保守结构域、保守基序原件等进行预测和分析.利用ClustalX(1.83)和MEGA6.0软件进行同源序列比对并构建系统进化树.运用实时荧光定量RT-PCR分析番茄UEV基因组织表达特异性及高盐、干旱、高温、低温胁迫下UEV基因的表达差异.[结果]从番茄基因组数据库中共鉴定到5个UEV家族基因,分别命名为SlUEV1~SlUEV5,分布在1、4、10三条染色体上.SlUEV的CDS长度为441~855 bp,氨基酸数目为146~284 aa,分子量在16.2~33.14 kD.SlUEV分为3个亚家族,其中SlUEV1、SlUEV2、SlUEV5属于UEV1亚家族,且其基因结构、保守结构域和保守基序均相似;SlUEV4属于COP10亚家族,而SlUEV3在拟南芥中并未找到同源蛋白,表明UEV家族在进化过程中发生分离.组织表达分析发现SlUEV1、SlUEV3分别在番茄花和茎中表达量高,SlUEV4 在果实发育期表达量高,而SlUEV2 和SlUEV.5呈组成性表达.非生物胁迫试验发现SlUEV对干旱胁迫较为敏感,多个SlUEV基因上调表达,表明SlUEV基因响应番茄干旱胁迫.[结论]番茄基因组中包括5个UEV家族基因,系统进化树分析将其分为3个亚家族.多个SlUEV基因在番茄不同组织表达存在差异,表明UEV基因影响番茄的生长发育.多个SlUEV基因在干旱胁迫下显著上调表达,推测其在番茄适应干旱胁迫过程中起着重要作用.该研究为后续开展番茄UEV基因调控植物生长和逆境胁迫功能研究提供理论基础.

分类号： S641.2

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