A型口蹄疫病毒A/HeN/1/2009株全基因组序列的测定及其基因特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谢毅

作者： 谢毅;牟一娇;朱琳;刘强;赵兴绪

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;A/HeN/1/2009株;全基因组;东南亚拓扑型

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2013 年 02 期

页码： 182-183+242

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]测定A型口蹄疫病毒A/HeN/1/2009株全基因组序列并分析其基因特征,为研究我国最近发生的A型口蹄疫病毒的致病性、流行规律以及筛选适用的疫情防控疫苗株奠定分子基础。[方法]应用RT-PCR方法,分段扩增、克隆A/HeN/1/2009株基因,并进行基因测序;借助DNAStar分子生物学软件,从分子流行病学角度分析A/HeN/1/2009株与参考毒株之间可能的遗传衍化关系。[结果]该毒株基因组全长8 171 nts[不包括poly(C)区段和poly(A)尾巴],其中5'-UTR和3'-UTR分别为1 080、92 nts,蛋白编码区为6 999 nts。分析A/HeN/1/2009株遗传衍化关系显示,该毒株划为东南亚拓扑型Laos03系的VN09亚系,同源性依次为87.3%～91.8%、93.7%～94.5%和96.9%～98.4%。[结论]VP1中A24V、N85R、S196T,3A中I61V、T128S、E147G和A134V在该毒群的进化过程中扮演重要角色;A/SH/1/2009株VP1 140-160基序为RSD。

分类号： S852.653

  • 相关文献

[1]口蹄疫病毒O型Mya98谱系猪源毒株和牛源毒株全基因组的比较. 吕律,杨帆,何继军,靳野,郭建宏,郑海学,刘湘涛. 2014

[2]口蹄疫病毒OT株的全基因组序列测定及比较分析. 吕占禄,王光祥,尚佑军,刘湘涛. 2012

[3]口蹄疫OX株全基因组cDNA的分子克隆、序列测定及分析. 孙世琪,郭慧琛,尚佑军,魏旭文,靳野,马军武,韩雪清,刘湘涛,谢庆阁. 2004

[4]口蹄疫病毒Hankou/99株基因组全序列测定与基因特征分析. 曾江勇. 2014

[5]微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展. 刘晓艳,闵勇,张薇,王开梅,万中义,江爱兵,张光阳,程贤亮,杨自文. 2013

[6]企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析. 施少华,黄瑜,程龙飞,傅光华,陈红梅,陈珍,苏敬良. 2009

[7]国内新型基因2型牛病毒性腹泻病毒研究进展. 张倩,陶洁,张东,区炳明,林航,杨颖,张信军,朱礼倩,王建业,贺生中,孟婷,谢静,朱国强. 2017

[8]草菇全基因组框架图. 鲍大鹏,赵国屏,谭琦,王升跃,陈明杰,郑华军,张劲松,朱永强,汪虹,康慧,陈祥,林楠,冯爱萍. 2010

[9]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[10]整合REV LTR的自然重组马立克氏病毒GX0101的全基因组序列分析. 周忠文,苏帅,崔宁,孙鹏,孙淑红,崔治中. 2017

[11]猪的全基因组范围内Fox转录因子家族的识别和进化分析. 宫磊,王志鹏,高会江. 2010

[12]Ⅰ型鸭肝炎病毒A66弱毒株全基因组分子克隆及序列分析. 黄显明,张小飞,魏建忠,李春芬,廖俊伟,毛火云. 2009

[13]Asial型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析. 郑海学,靳野,尚佑军,郭建宏,田宏,杨亚民,刘湘涛,才学鹏. 2010

[14]黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)的全基因组测序和基因组特征研究. 区又君,温久福,李加儿,梁洪海. 2020

[15]藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析. 时丕彪,王德领,蒋润枝,李斌,晏军,方迪,闫凯旋,顾闽峰. 2022

[16]腺病毒7d基因型与7b基因型全基因组比较分析. 任洛,付扬喜,郑首燕,王鹂鹂,倪科,王莉佳,臧娜,谢晓虹,邓昱,刘恩梅. 2017

[17]木贼镰孢菌D25-1全基因组序列的测定及结构分析. 李雪萍,李建宏,漆永红,郭成,李潇,李敏权. 2019

[18]一株猪捷申病毒全基因组序列测定及分析. 黎少国,张建峰,张春红,沈海燕,刘志成. 2017

[19]苦荞全基因组SSR位点特征分析与分子标记开发. 马名川,刘龙龙,刘璋,周建萍,南成虎,张丽君. 2021

[20]番鸭细小病毒和鸭3型腺病毒的分离鉴定及其全基因组序列分析. 张瑞,陈长福,刘荣昌,程龙飞,傅光华,施少华,陈红梅,万春和,傅秋玲,黄瑜. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序