基于叶绿体 DNA 分析的辽宁省梨属种质遗传多样性研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 常耀军

作者： 常耀军;曹玉芬;张金梅;田路明;董星光;张莹;齐丹;郑迎春

作者机构：

关键词： 梨;叶绿体DNA;单倍型;遗传多样性

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2014 年 41 卷 7 期

页码： 1307-1316

收录情况： CSCD

摘要： 从32对叶绿体DNA通用引物中筛选出8对引物用于评价辽宁省梨属种质的遗传多样性,其中4对引物所扩增的叶绿体DNA片段存在突变位点。合并后的叶绿体基因片段(3 688 bp)含有单一突变位点9个、简约信息性位点3个以及插入/缺失(INDEL)2个。在37个样品中,trnL-trnF-487区域、 trnL-trnF-413区域、rbcL区域和trnS-psbC区域的单倍型分别为2个、4个、2个和3个,合并之后的叶绿体基因片段的单倍型为4个。非编码区trnL-trnF-413多态性最高,具有最高的单倍型数、最高的单倍型(基因)多样性、最高的核苷酸多样性、最高的单倍型多样性方差和最高的单倍型多样性标准差。辽宁省37份梨种质的单倍型(基因)多样性(H_d)、核苷酸多样性(P_i)分别为0.577、0.00055。Tajima’s D检验中除了rbcL区域的D值在P<0.05水平上显著外,其余区域的D值未达显著水平,表明自然选择对 rbcL区域的突变位点产生了作用。秋子梨和白梨种质共有单倍型HAP_1、HAP_2和HAP_3,显示出一定的亲缘关系;西洋梨则单独共享HAP_5。运用中介邻接网络(Median-Joining network,MJ)算法绘制的中介网络图显示HAP_1与HAP_2、HAP_3的亲缘关系较远,而HAP_5则与上述3个单倍型的亲缘关系较远。

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