铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李亚萍

作者： 李亚萍;金福来;黄宗贵;张涛;段晓婧;姜武;陶正明;陈家栋

作者机构：

关键词： 铁皮石斛;糖苷水解酶GH3;生物信息学分析;基因表达模式

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 790-799

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用生物信息学方法对铁皮石斛GH3基因家族成员进行筛选、鉴定，对其基因结构、蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、蛋白质二级结构及跨膜预测、基序及染色体定位进行分析，同时分析GH3基因家族在不同组织以及低磷与正常磷水平下的表达模式。在铁皮石斛全基因组中筛选得到13个GH3家族基因，其中一个基因存在可变剪切，表达为14个GH3蛋白。GH3基因家族蛋白可分为3个亚家族，各亚家族中不同基因相对保守；各成员均含有内含子与外显子，内含子相位在0～2,13个基因分布在8染色体上。GH3基因家族在铁皮石斛的8个组织中均有表达，其中白根和花蕾表达量高，茎和唇瓣低，推测GH3基因家族可能参与铁皮石斛根系生长以及开花现蕾。低磷与正常磷水平表达结果表明，低磷水平下叶中基因LOC110110392、LOC110100144表达上调，根中基因LOC110095762、LOC110107269表达上调。该研究对铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族成员生物信息学、在不同组织以及正常磷与低磷条件下的表达水平进行研究分析，筛选响应低磷信号的糖苷水解酶基因，为后期研究糖苷水解酶参与低磷条件下铁皮石斛多糖代谢调节机制提供研究基础。

分类号： S567.239

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