油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因的鉴定与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 肖勇
作者: 肖勇;雷新涛;王永;曹红星;石鹏;金龙飞;夏薇
作者机构:
关键词: 油棕;ACC基因;转录组;RPKM
期刊名称: 安徽农业科学
ISSN: 0517-6611
年卷期: 2017 年 31 期
页码: 154-155+159
摘要: [目的]对油棕乙酰CoA羧化酶(ACC)基因进行鉴定与表达分析。[方法]采用生物信息学方法鉴定油棕的ACC基因,并应用拟南芥的ACC基因蛋白质序列比对油棕的蛋白质库,应用已有油棕转录组信息,研究ACC基因在不同组织中的表达情况。[结果]在油棕中鉴定了2个ACC基因,命名为EgACC1和EgACC2。EgACC1不含内含子,而EgACC2含有32个内含子;EgACC1在不同组织中都没有表达,而EgACC2在所有组织中都有表达,其中在组培苗中有较高的表达量,同时,在油棕果发育21 d时有高的表达水平,RPKM值为70.6,为所有组织中最高。[结论]该研究阐述了油棕ACC基因的表达模式,为油棕ACC基因的功能分析奠定了基础。
分类号: Q943.2`S565.9
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