鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 耿立英

作者： 耿立英;张传生;杜立新

作者机构：

关键词： 鸡;非翻译区;小RNA;生物信息学;单核苷酸多态性

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2008 年 30 卷 08 期

页码： 1026-1032

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： GDF-8、IGF-I、IGF-III、IGF2R、IGFBP2和GHR是鸡的重要经济性状候选基因。利用miRanda和Targetscan软件预测6个基因3′UTR潜在的microRNA靶标,并发掘靶标区域SNP位点。结果表明:在6个基因的26个microRNA靶标区域,共检测到125个SNP位点,在靶标及其5′和3′邻接等长侧翼区分别检测到47个、44个和35个SNPs位点,其中12个SNP定位于靶标种子序列互补区。种子序列互补区及其3′侧翼区的SNP位点可能会影响microRNA的调控,导致家禽的表型变异。

分类号： S831

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