草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘建成

作者： 刘建成;段可;李静;叶正文;苏建宇

作者机构：

关键词： 草莓;NBS-LRR基因;同源克隆;基因结构;进化树;RT-PCR

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2011 年 06 期

页码： 1025-1031

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2 434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1 893 bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表达,但在茎尖分生组织中表达水平最高,且在叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响。

分类号： S668.4

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