魁蚶(Scapharca broughtonii)不同地理群体的遗传多样性及种群结构

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘寒苗

作者： 刘寒苗;吴彪;刘志鸿;杨爱国;周丽青;孙秀俊

作者机构：

关键词： 魁蚶;COⅠ基因;12S rRNA基因;18S rRNA基因;28S rRNA基因;遗传多样性

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 92-99

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR技术扩增了中国山东胶南、长岛、蓬莱、荣成和韩国统营5个地理群体魁蚶(Scapharca broughtonii)样本的COⅠ、12S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因部分序列,分析了魁蚶5个地理群体的遗传多样性和系统进化关系。经测序拼接、剪接后,分别获得67条776 bp的COⅠ序列、72条443 bp的12S rRNA序列、75条909 bp的18S rRNA序列和75条894 bp的28S rRNA序列。序列分析结果显示,5个群体75个个体的COⅠ序列中共检测到466个多态位点,32种单倍型,单倍型多样性指数为0.925,核苷酸多样性指数为0.086;12S rRNA序列中共检测到292个多态位点,43种单倍型,单倍型多样性指数是0.928,而核苷酸多样性为0.0856;在18S rRNA序列中,5个群体都表现出丰富的遗传多样性,共有74种单倍型,909个多态位点,单倍型多样性指数为1.0,核苷酸多样性指数为0.717,其中胶南群体变异位点最多、多样性最丰富;通过对28S rRNA部分序列的分析发现,75个个体共检测到27个多态位点,18种单倍型,单倍型多样性指数为0.778,核苷酸多样性指数为0.289,蓬莱群体多样性最丰富。遗传距离分析结果表明,韩国群体与其他4个群体的遗传距离较大;基于COⅠ序列的系统进化树显示有多个聚群。

分类号： S917.4

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