DNA条形码技术在鲻科鱼类鉴定中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘璐

作者： 刘璐;孙典荣;李纯厚;韩志强;高天翔;宋娜

作者机构：

关键词： 鲻科;COI基因;DNA条形码;物种鉴定;系统发育

期刊名称： 中国海洋大学学报(自然科学版)

ISSN： 1672-5174

年卷期： 2016 年 46 卷 11 期

页码： 178-186

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究选用DNA条形码的通用基因片段,采用特异性扩增测序及与GenBank已有序列结合分析的方法,进行了鲻科(Mugilidae)6属17种鱼类的COI基因片段的序列比较、分子树构建和系统进化研究。研究表明,在所得的17种鲻科鱼类共有的555bp COI基因片段中平均GC含量为46.9%。其中,第二密码子位点含量最高(49.8%~56.2%),平均54.9%;第一密码子变化范围最大(31.9%~48.6%),平均42.9%;第三密码子差别不显著(42.5%~43.4%),平均42.7%。依据Kimura-2-parameter模型(K2P),17种鲻科鱼类种内遗传距离的平均值为0.004 5,种间遗传距离为0.191,是种内遗传距离的42倍。在分子系统树上,所有物种均呈单系,5属为独立分支,只有隶属于梭属(Liza)的尖头梭(Liza tade)与莫鲻属(Moolgarda)聚类,表现出与传统形态学分类不一致的结果。本研究结果验证了线粒体COI基因作为DNA条形码对鲻科鱼类进行物种鉴定的有效性,可用于辅助探讨鲻科科下属、种分类阶元系统发育问题。

分类号： S917.4

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