文献类型： 中文期刊
第一作者： 马娟
作者： 马娟;曹言勇;李会勇
作者机构： 河南省农业科学院粮食作物研究所
关键词： 玉米;全基因组关联分析;FarmCPU;穗轴粗
期刊名称： 作物学报
ISSN： 0496-3490
年卷期： 2021 年 007 期
页码： 1228-1238
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 玉米穗轴粗是一个影响玉米产量和穗轴产量的重要性状,其遗传机制的解析可以对高产育种提供指导。本研究以309份玉米自交系为材料,利用测序基因型分型技术对其进行基因型鉴定。采用FarmCPU（fixed and random model circulating probability unification）、MLMM （multiple loci mixed linear model）和CMLM （compressed mixed linear model）方法,对2017年和2019年河南原阳、河南郸城、河南虞城、海南三亚以及最佳线性无偏估计值环境的穗轴粗,进行全基因组关联分析,共鉴定12个与穗轴粗显著关联的SNP （single nucleotide polymorphisms）（P<8.60E-07）。其中,S429277313利用FarmCPU和MLMM方法在2017年原阳均检测到。S129006330、S2170889116、S22046026464和S483821463的表型变异解释率介于10.23%～14.17%,为主效SNP。而且,S129006330位于已定位的穗轴粗QTL（quantitative trait loci）区间内。共挖掘17个候选基因,其中WAKL14（wall-associated receptor kinase-like 14）、转录因子ZIM35（zinc-finger protein expressed in inflorescence meristem 35）、HMGA（HMG-Y-related protein A）、组蛋白-赖氨酸N甲基转移酶ATX4（Arabidopsis trithorax 4）和XTH32（xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 32）,可能是影响穗轴粗的重要基因。挖掘的4个穗轴粗主效SNP和5个候选基因可以为分子标记辅助育种、精细定位和基因克隆提供信息。
分类号： S513
- 相关文献
[1]玉米株高和穗位高的全基因组关联分析. 钱甫,张占琴,陈树宾,桑志勤,李卫华. 2024
[2]玉米穗行数全基因组关联分析. 张焕欣,翁建峰,张晓聪,刘昌林,雍洪军,郝转芳,李新海. 2014
[3]温热带玉米株高的全基因组关联分析. 郭子锋,徐孝洁,刘小刚,王山荭. 2020
[4]玉米穗位高全基因组关联分析及其候选基因预测. 李博,张焕欣,杨小艳,吕颖颖,江培顺,郝转芳,吕香玲,王宏伟,翁建峰. 2013
[5]玉米杂交群体产量性状及其特殊配合力全基因组关联分析. 马娟,曹言勇. 2024
[6]玉米叶片硝酸盐积累性状的全基因组关联分析. 邬奇,孙扬名,桑俊伟,周玲,赵涵. 2024
[7]玉米Suwan种质改良过程中的关键基因组区段发掘. 李秀诗,吴迅,吴文强,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,陈泽辉. 2019
[8]玉米耐深播相关性状的全基因组关联分析. 陈芳,张进艳,李亮,马艺文,王振萍,段运平,郝转芳. 2014
[9]玉米苗期淹水性状全基因组关联分析. 狄邺,孙萍东,关媛,顾炜,郑洪建,邹华文,张学才,施标,于典司,张丙林. 2023
[10]玉米子粒氮浓度全基因组关联分析. 王利锋,王浩,周柯,杨继伟,曹言勇,李晶晶,贾腾蛟,李会勇. 2023
[11]玉米花期根系结构的表型变异与全基因组关联分析. 张小琼,郭剑,代书桃,任元,李凤艳,刘京宝,李永祥,张登峰,石云素,宋燕春,黎裕,王天宇,邹华文,李春辉. 2019
[12]周岁细毛羊羊毛长度、产毛量与体质量的全基因组关联分析. 狄江,刘剑锋,徐新明,王琼,拉扎特·艾尼瓦尔,于丽娟. 2016
[13]中国美利奴(新疆型)羊毛弯曲频率性状的全基因组关联分析. 狄江,刘剑锋,徐新明,拉扎特·艾尼瓦尔,于丽娟. 2015
[14]滩羊毛色的全基因组关联分析. 王晓薇,马青. 2020
[15]陆地棉自然群体纤维强度性状的全基因组关联分析. 贾冰,贾冰,马建江,宋吉坤,裴文锋,吴嫚,臧新山,张金发,陈全家,于霁雯. 2021
[16]海南短日照条件下谷子穗部性状的全基因组关联分析. 贾小平,张博,董志平,全建章,王永芳,张小梅,袁玺垒,李剑峰,戴凌峰. 2018
[17]不同光周期条件下谷子株高的全基因组关联分析. 贾小平,张博,全建章,李剑峰,王永芳,袁玺垒. 2019
[18]缺铁胁迫对小麦苗期叶绿素含量的影响及SPAD值的GWAS分析. 樊庆琦,黄承彦,解树斌,隋新霞,崔德周,李永波,楚秀生. 2018
[19]小麦根部耐盐性状全基因组关联分析. 时晓磊,严勇亮,石书兵,王继庆,谢磊,张金波,耿洪伟. 2021
[20]西南地区小麦种质资源白粉病抗性的全基因组关联分析. 高煜,程斌,丁延庆,曹宁,高旭,张立异. 2021
作者其他论文 更多>>
-
玉米穗粗一般配合力多位点全基因组关联分析和基因组预测
作者：马娟;黄璐;宇婷;郭国俊;朱卫红;刘京宝
关键词：玉米;穗粗;一般配合力;多位点全基因组关联分析;基因组选择;固定效应模型
-
甘薯斑驳坏死病发生的温度效应和防控药剂筛选
作者：王容燕;高波;李秀花;陈书龙;马娟
关键词：甘薯;斑驳坏死病;终极腐霉;杀菌剂;毒力
-
玉米茎腐病致病菌全基因组分泌蛋白预测与分析
作者：曹言勇;张立立;李慧敏;韩胜博;侯梦薇;段灿星;施艳;张新友
关键词：玉米;九州镰孢菌;生物信息学;分泌蛋白
-
玉米杂交群体产量性状及其特殊配合力全基因组关联分析
作者：马娟;曹言勇
关键词：玉米;杂交种;特殊配合力;全基因组关联分析
-
噻唑膦与硅肥联合使用对甘薯茎线虫病的防治效果
作者：马娟;高波;李秀花;王容燕;黄山;陈书龙
关键词：甘薯茎线虫;噻唑膦;硅肥;增效作用
-
不同玉米单倍体诱导系杂交组合F1诱导率的评价
作者：杨继伟;王利锋;李晶晶;王浩;贾腾蛟;李会勇
关键词：玉米;单倍体;诱导系;诱导率;杂种优势
-
基于核酸靶标免扩增CRISPR/Cas体系的分子速测技术研究进展
作者：李柚;张岩;雒嘉炜;徐丹红;马娟;高梦祥;刘华;曾海娟;王金斌
关键词：成簇规则间隔短回文重复序列(CRISPR);免扩增检测;体系优化;信号放大
