西藏拟溞Daphniopsis tibetana核糖体18S和ITS2序列克隆及进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 史楠冰

作者： 史楠冰;赵文;刘卫东;魏杰;安浩;季世琛

作者机构：

关键词： 西藏拟溞;18S rDNA;ITS2;遗传距离;进化分析

期刊名称： 生物学杂志

ISSN： 2095-1736

年卷期： 2018 年 35 卷 06 期

页码： 37-41

收录情况： CSCD

摘要： 利用PCR反应扩增出西藏拟溞Daphniopsis tibetana核糖体18S和转录间隔区II (ITS2)片段,经克隆测序后获得其序列,在此基础上研究西藏拟溞分类进化地位。西藏拟溞18S rDNA序列长2296 bp,A、T(U)、G、C含量分别为21.2%、24.4%、29.8%和24.6%; ITS2序列长度平均为1229 bp,A、T(U)、G、C含量平均为28.3%、23.5%、25.5%及22.7%。采用最大似然法(ML)构建的18S rDNA系统进化树显示,西藏拟溞D.tibetana和方角拟溞D.quadrangula亲缘关系最近,在进化树上聚集在同一分支;和溞属的大型溞Daphnia magna在不同分支上,该结果再次证明了西藏拟溞在分类上应归属于拟溞属。与18S rDNA相比,西藏拟溞ITS2序列存在个体间碱基及长度差异,与同科异属物种之间差异更大。获得的西藏拟溞18S rDNA、ITS2序列,为该种进一步的分子水平研究提供了基础数据。

分类号： Q953

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