镰孢菌属实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈利达

作者： 陈利达;袁军海;李磊;石延霞;柴阿丽;谢学文;李宝聚

作者机构： 中国农业科学院蔬菜花卉研究所;河北北方学院

关键词： 镰孢菌;实时荧光定量PCR;湿度;病残体

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2019 年 S1 期

页码： 296-301

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了建立一种快速检测镰孢菌属的方法。根据Fusarium翻译延伸因子(TEF-1α)基因序列,设计并筛选其特异性引物F8-1/F8-2,能从靶标基因组DNA中特异性扩增出大小为187 bp的目的片段,建立Fusarium荧光定量PCR(RT-PCR)检测体系的灵敏度比常规PCR高104倍,且特异性良好。利用该反应体系检测不同湿度环境下病残体和土壤病残体DNA含量的动态变化。结果表明:病残体及土壤病残体DNA初始拷贝数分别为6. 90×10~(11),1. 06×10~(12)拷贝数/g,经过温度27℃、80%湿度下处理30 d病残体DNA含量下降至5. 55×10~8和0拷贝数/g,而在温度27℃、20%湿度下含量分别为8. 04×10~9,1. 30×10~9拷贝数/g。因此,建立的Fusarium实时荧光定量PCR检测体系具有特异性强、灵敏度高的特点,可以快速准确地定量检测病残体DNA的含量,为瓜类根腐病的早期预防和流行监测提供了有效的技术手段。

分类号： S432.4

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