藏羊HIF-1α基因CDS区多态性及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨敏

作者： 杨敏;韩吉龙;岳耀敬;史兆国;郭婷婷;吴瑜瑜;王朝风;郭健;刘建斌;孙晓萍;牛春娥;杨博辉

作者机构：

关键词： 藏羊;HIF-1α基因;多态性;生物信息学

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2013 年 41 卷 10 期

页码： 12-16

收录情况： 北大核心

摘要： 应用DNA混池测序法检测藏羊HIF-1α基因CDS区的多态性,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行预测和分析。结果表明,在藏羊群体中发现HIF-1α基因CDS区有4个SNP,其中901G→A为错义突变,其余为同义突变;HIF-1α基因包含1个2 295 bp的开放阅读框,编码764个氨基酸,其编码蛋白属于亲水性蛋白;二级结构主要以无规则卷曲和α基因螺旋为主;HIF-1α基因编码产物氨基酸同源分析表明,藏羊HIF-1α编码的氨基酸与山羊、牦牛的遗传距离较近,具有高度同源性。

分类号： S826.83

  • 相关文献

[1]藏羊VEGF-A基因编码区多态性及生物信息学分析. 王朝风,岳耀敬,刘建斌,郭婷婷,韩吉龙,杨敏,赵帅,杨博辉. 2013

[2]百宜黑鸡PRL基因多态性检测与生物信息学分析. 韩雪,吴松成,伍革民,粟朝芝,朱丽莉,陶宇航,陈林. 2018

[3]麻城黑山羊MC4R基因遗传多态性及生物信息学分析. 郭帅,杨娟,刘诗雨,杨丰利,熊琪,汪招雄. 2021

[4]北山羊与绒山羊杂交F1代DQA1基因外显子2多态性与CDS区生物信息学分析. 吕雪峰,许艳丽,胡昕,赛迪古丽·赛买提,王乐. 2021

[5]乌蒙凤鸡生长激素基因多态性及生物信息分析. 陆静,骆科印,王现科,张雄,杨红,莫先艇,黄明捷,张勇. 2018

[6]绵羊味觉受体第一家族基因外显子多态性分析. 轩俊丽,马晓萌,袁泽湖,胡师金,王慧华,魏彩虹,赵福平,张莉,杜立新. 2016

[7]真核生物启动子研究概述. 李圣彦,郎志宏,黄大昉. 2014

[8]猪CD4基因多态性及生物信息学分析. 许金根,赵磊,顾有方,李升和,李庆岗. 2018

[9]不同物种Mlo基因生物信息学分析. 陈玲,邱显钦,张颢,晏慧君,王其刚,唐开学. 2012

[10]自然感染巴氏杆菌藏羊组织器官的病理学研究. 赵书艺,高欣,方梅,贾宁. 2014

[11]HIF-1α基因G901A多态性与高海拔低氧适应的相关性. 杨敏,史兆国,韩吉龙,岳耀敬,郭婷婷,郭健,刘建斌,孙晓萍,王朝风,杨博辉. 2013

[12]藏羊瘤胃发酵参数对燕麦干草为饲粮限饲的响应及其氮维持需要量估测. 张瑛,周建伟,刘浩,米见对,龙瑞军. 2014

[13]燕麦干草对藏羊尿中嘌呤衍生物、肌酐及马尿酸排出量的影响. 刘浩,周建伟,张瑛,尚占环,米见对,龙瑞军. 2014

[14]青藏高原东北缘放牧绵羊血清矿物元素动态研究. 辛国省,龙瑞军,郭旭生. 2011

[15]3种不同类型藏羊的屠宰性能和肉品质的比较分析. 周文静,袁泽湖,李熙成,郭淑珍,兰贵生,闫佰鹏,李发弟,李万宏,乐祥鹏. 2019

[16]人工喂养与自由牧食藏羊的食草咀嚼行为音频特征. 左丽诗,陆明洲,盛航,张海林,段光辉,尹旺. 2019

[17]低氮条件下饲粮能量水平对藏羊体外发酵特性及产气量的影响. 王文基,郭亚敏,康婧鹏,景小平,许卫星,龙瑞军,尚占环,周建伟. 2019

[18]不同能量水平低氮饲粮对藏羊表观消化率、氮代谢和生长性能的影响. 康婧鹏,王文基,郭亚敏,景小平,仲崇亮,郭伟,龙瑞军,周建伟. 2018

[19]低氮条件下饲粮能量水平对藏羊尿嘌呤衍生物排出量和瘤胃微生物氮产量的影响. 郭亚敏,王文基,康婧鹏,刘虎,景小平,龙瑞军,周建伟. 2018

[20]陶×藏一代羔羊肉用性能分析. 肖西山,冶政云,张英,王忠民. 2004

作者其他论文 更多>>

微信小程序