华重楼灰霉病菌灰葡萄孢ITS分型及SSR遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王帆帆

作者： 王帆帆;唐涛;曾佳;郭杰;唐其;郭晓亮;段媛媛;游景茂

作者机构：

关键词： 灰葡萄孢;rDNA-ITS;SSR-PCR;遗传结构;聚类分析

期刊名称： 菌物学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 003 期

页码： 566-579

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 华重楼灰霉病在湖北和湖南两省多有发生,已对华重楼药材生产构成了严重威胁。为明确该病菌的遗传多样性水平,本研究对分离自两省10个地区的92株华重楼灰霉病菌进行了rDNA-ITS分子鉴定,同时采用SSR-PCR技术进行了遗传多样性分析。rDNA-ITS分子鉴定结果表明92株病原菌均为灰葡萄孢Botrytis cinerea,ITS系统发育树可初步显示其遗传多样性丰富。SSR-PCR多样性分析结果表明,应用9对SSR引物共检测出109个等位基因位点,等位基因和有效等位基因平均值分别为12和3.6589,香农指数和多态信息含量平均值分别为1.5048和0.6196。10个群体各自有效等位基因在1.622-3.971之间;香农指数在0.527-1.582之间;观测杂合度在0.148-0.593之间;期望杂合度在0.321-0.708之间。Nei遗传距离为0.15时,UPGMA聚类树可将92株病菌划分为4个类群。群体间基因流值为0.19-4.67,遗传分化值为0.047-0.638,群体遗传同一性和遗传距离范围值分别为0.1531-0.9679和0.0327-1.8766。综上所述,湖北和湖南两省华重楼灰霉病菌群体存在明显的遗传多样性,这为湖北和湖南两省区华重楼灰霉病的科学防治提供了理论依据。

分类号： S435.672

  • 相关文献

[1]山东省小麦禾谷孢囊线虫rDNA-ITS序列特征和基于ISSR的遗传多样性分析. 梁晨,赵洪海,彭德良. 2015

[2]大麦SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析. 王晋,王世红,赖勇,孟亚雄,李葆春,马小乐,尚勋武,王化俊. 2014

[3]四川野生斑茅居群遗传结构的SRAP分析. 张瑜,鄢家俊,白史且,彭燕,梁绪振,张建波,张劲,胡超. 2015

[4]利用EST-SSR评估糜子资源遗传差异. 石甜甜,何杰丽,高志军,陈凌,王海岗,乔治军,王瑞云. 2019

[5]利用荧光SSR分析中国糜子遗传多样性. 王瑞云,季煦,陆平,刘敏轩,许月,王纶,王海岗,乔治军. 2017

[6]基于SSR标记的山西野生大豆种质资源遗传多样性分析. 张海平,陈妍,王志,王海岗,周建萍. 2019

[7]用高基元微卫星标记分析中国糜子遗传多样性. 王瑞云,刘笑瑜,王海岗,陆平,刘敏轩,陈凌,乔治军. 2017

[8]Mx基因抗性位点在12个地方鸡种中的分布及遗传结构分析. 李慧芳,陈宽维,韩威,朱云芬,张学余,王强. 2009

[9]利用微卫星标记分析山西糜子的遗传多样性. 王舒婷,何杰丽,石甜甜,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2019

[10]利用荧光SSR分析中国糜子遗传多样性. 王瑞云,季煦,陆平,刘敏轩,许月,王纶,王海岗,乔治军. 2016

[11]南瓜SSR-PCR反应体系的优化. 孟令君,李柱刚,韩俊岩,王珣,陆杰,付玉杰. 2013

[12]正交设计优化大豆SSR-PCR反应体系及引物筛选. 苏辉,李志刚,宋书宏. 2009

[13]马铃薯SSR-PCR反应体系的建立和优化. 张凤军,张永成. 2011

[14]食用向日葵SSR-PCR反应体系的优化. 胡小利,马庆,包海柱,范瑞,孙希利,马蓉. 2015

[15]谷子种子DNA快速提取新方法. 庞冰,王艳梅,郝建平,王陆军,王创云,李培良,邓艳芳,周琼,李志敏,董永军,张婷婷,裴成成,牛学谦. 2018

[16]蚕豆SSR-PCR体系建立及优化. 沙伟超,侯万伟,刘玉皎,田莹莹,武学霞. 2017

[17]福建省53份茶树种质资源SSR-PCR反应体系的优化. 朱晨,田采云,张舒婷,常笑君,傅海峰,李小桢,陈常颂,林玉玲,郭玉琼. 2018

[18]冬瓜SSR-PCR体系优化及引物筛选. 潘珍珍,吴才君,刘文睿,江彪,谢大森. 2015

[19]二月兰SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选. 贾新平,孙晓波,梁丽建,苏家乐,邓衍明. 2017

[20]杏SSR反应体系的优化研究. 宁宁,王玉柱,张俊怀,杨丽,孙浩元,章镇. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序