不同光质条件下刺葡萄红色愈伤组织的RT-qPCR内参基因筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 潘红

作者： 潘红;赖呈纯;张静;黄贤贵;林玉玲;赖钟雄

作者机构：

关键词： 刺葡萄;红色愈伤组织;光质;内参基因;实时荧光定量PCR

期刊名称： 应用与环境生物学报

ISSN： 1006-687X

年卷期： 2019 年 06 期

页码： 1407-1413

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 不同光质对刺葡萄红色愈伤组织(DLR)花青素的积累以及细胞生长具有重要影响.利用RT-qPCR进行不同光质培养的刺葡萄红色愈伤组织功能基因的表达分析,筛选适用于不同光质下RT-qPCR分析的内参基因.以9种光质(黑暗、白光、红光、黄光、蓝光、绿光、紫光、暖白光、暖黄光)下培养获得的刺葡萄红色愈伤组织为材料,对10个葡萄中常用的内参基因进行RT-qPCR分析.结果显示,geNorm、Normfinder、BestKeeper等3个内参分析软件因算法不同,内参稳定性排名具有一定差异. ge Norm评估排名前5的内参基因为α-Tubulin=AP-2> 60SRP> EF1-α> UBQ;Normfinder计算排名前5的内参为60SRP> AP-2>α-Tubulin> EF1-α> GAPDH;BestKeeper分析的前5个基因依次为UBQ>α-Tubulin> 60SRP> EF1-α> SAND.α-Tubulin、60SRP在3个软件评估中排名最为稳定靠前,NAD5则为最不稳定候选内参基因.拟定α-Tubulin、60SRP为最适内参,对目的基因UFGT进行验证,验证结果显示α-Tubulin、60SRP表达趋势相似,具有较高的稳定性,其组合可获得较为精准的表达分析结果.本研究结果可为后续光质处理刺葡萄红色愈伤组织的基因表达研究提供理论基础.(图5表2参39)

分类号： S663.1

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