蓝塘猪和大白猪消减cDNA文库与差异基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蔡更元

作者： 蔡更元;陈瑶生;李加琪;张豪;王翀

作者机构：

关键词： SSH;肌肉组织;差异表达基因;消减cDNA文库

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2011 年 44 卷 12 期

页码： 2553-2560

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】寻找肉质性状候选优势表达基因,研究猪肉质优良性状的遗传基础和分子机制。【方法】利用抑制性消减杂交技术构建蓝塘猪和大白猪肌肉组织差异表达的消减cDNA文库,利用实时荧光定量PCR法研究基因的差异表达。【结果】获得61个有效克隆。对整个文库进行测序分析,获得47条有效序列。用BLAST在线软件与GenBank和GenBank EST等数据库进行同源序列比较,发现其中有2条未知序列。对文库中所包含的MYL1、LDHA、KPNA3、TPM3、HUMMLC2B、GNTN和Oaz等基因进行了实时荧光定量PCR检测,结果显示MYL1、LDHA、KPNA3、TPM3和HUMMLC2B这5个基因在蓝塘猪肌肉组织的表达量显著高于大白猪(P<0.05);GNTN和Oaz基因在大白猪肌肉组织中的表达量显著高于蓝塘猪(P<0.05)。【结论】很多EST与肉质有关的重要基因具有很高的同源性,这些基因在蓝塘猪和大白猪中表达差异显著(P<0.05)。

分类号： S828

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