石榴果皮DAHPS基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 冯立娟

作者： 冯立娟;尹燕雷;杨雪梅;武冲;李英朋

作者机构：

关键词： 石榴;DAHPS基因;克隆;序列分析;没食子酸

期刊名称： 北方园艺

ISSN： 1001-0009

年卷期： 2016 年 13 期

页码： 98-103

收录情况： 北大核心

摘要： 以‘泰山红’石榴果实为试材,利用RT-PCR技术克隆石榴果皮DAHPS部分基因并对其进行了生物信息学分析。结果表明:获得1 373bp的DAHPS基因cDNA片段编码393个氨基酸,其氨基酸序列与甜橙(XP_006472576.1)、白梨(XP_009372963.1)、葡萄(NP_001268096.1)、苹果(XP_008386115.1)的相似性分别为94%、93%、92%、92%;预测蛋白质理论分子量约为44kDa,等电点为9.00,具有Cys-Ser-Ala-His保守区和典型的DAHP_synthe_2超家族保守结构域,为亲水性和跨膜蛋白,不是分泌蛋白;蛋白质二级结构主要由无规则卷曲(40.97%)、α?螺旋(38.17%)、伸展链(12.47%)和β?转角(8.40%)组成。GenBank登录号为KU198932。该研究结果为揭示石榴果实中没食子酸的代谢机理奠定了理论基础。

分类号： S665.4

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