芝麻SSR检测体系的优化与应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘红艳

作者： 刘红艳;杨敏敏;左阳;舒岩;赵应忠

作者机构：

关键词： 芝麻;SSR;检测体系优化

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2011 年 27 卷 21 期

页码： 138-143

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了建立一套适用于芝麻SSR标记检测的技术体系,以5个芝麻新品种为试验材料,选用35对SSR引物,从反应体系、反应程序、电泳、银染4个环节进行优化。结果表明:反应总体积为10μL,优化后的基本成分及用量分别为25mmol/L Mg2+1.2μL,10mmol/L dNTPs0.3μL,5U/μL Taq酶0.3μL,50ng/μL Primer0.9μL,10×Buffer0.7μL,25ng/μL DNA模板2.5μL,ddH2O4.1μL。反应程序为:94℃3min;94℃1min,60℃30s,72℃45s,10个循环;94℃30s,57℃30s,72℃45s,30个循环;72℃5min。PCR产物用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,硝酸银快速染色检测效果良好。筛选出多态性较强的SSR引物24对,用这些引物对20个品种进行扩增,初步分析了SSR标记应用于芝麻DNA指纹分析的潜力。

分类号： S565.3

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