鲤多拷贝基因MRC1的全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 常松欢

作者： 常松欢;王嘉利;许建;张瀚元;张天杨;江炎亮

作者机构：

关键词： 鲤;甘露糖受体C1型;多拷贝基因;系统进化树;嗜水气单胞菌

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN：

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 85-94

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 甘露糖受体C1型基因（mannose receptor C-type 1, MRC1）是C型凝集素超家族的成员之一，其编码的甘露糖受体是一种模式识别受体，在先天免疫反应中发挥关键作用。MRC1基因在哺乳动物免疫反应中的作用被广泛研究，但在鱼类中的研究较少。近年来，随着高密度集约化养殖模式的发展，由病原微生物引发的疾病频繁暴发，其中，嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）是常见的致病菌之一。本研究首次在鲤（Cyprinus carpio）全基因组范围鉴定MRC1基因，共发现11个基因拷贝，并进行了功能域预测、共线性分析、多序列比对和系统进化分析，结果表明，MRC1基因在物种进化过程中保守程度较高。拷贝数比较分析发现，MRC1基因在不同物种中表现出不同程度的多拷贝现象，在多数鱼类中发现2个拷贝，而在鲤中发现多达11个拷贝。同时，比较了各拷贝在健康鲤脑、肌肉、肝脏和脾脏组织中的表达情况，发现在免疫相关组织脾脏中的表达量相对高于其他组织。进一步对感染嗜水气单胞菌4、12、24 h后在鲤脾脏中的表达进行差异比较分析，发现不同拷贝的表达特征各有差异，其中，HHLG13g0734在感染嗜水气单胞菌4 h后表达显著上调，HHLG13g0734在感染24h后表现出极显著上调，HHLG3g0497在整个感染过程中表达显著下调，表明鲤MRC1基因只有部分拷贝保留了免疫相关功能及参与机体的免疫反应。本研究结果有助于进一步了解鲤MRC1基因在抵抗嗜水气单胞菌感染过程中发挥的免疫功能，并为分子选育抗病新品系提供一定的数据基础。

分类号： S917.4

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