高通量测序与传统纯培养方法在牡蛎微生物群落分析中的应用对比

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹荣

作者： 曹荣;张井;孟辉辉;赵玲;刘淇

作者机构：

关键词： 高通量测序;牡蛎;微生物群落结构

期刊名称： 食品科学

ISSN： 1002-6630

年卷期： 2016 年 37 卷 24 期

页码： 137-141

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示牡蛎体附着的微生物群落结构特征,采用Illumina Hi Seq高通量测序技术对牡蛎的细菌种类进行了分析,并与传统纯培养方法的分析结果进行对比。结果表明,牡蛎体附着的细菌以变形菌门(Proteobacteria,77.5%)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria,72.3%)为主;在目的分类水平上,弧菌目(Vibrionales,49.3%)、交替单胞菌目(Alteromonadales,12.2%)占优势;在科的分类水平上,主要是弧菌科(Vibrionaceae,36.8%)、希瓦氏菌科(Shewanellaceae,10.3%)和交替假单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae,7.2%);在属的分类水平上,弧菌属(Vibrio,28.3%)、希瓦氏菌属(Shewanella,10.3%)、交替假单胞菌属(Pseudoalteromonas,7.2%)比例相对较高。高通量测序分析结果中,丰度前3位的菌属与纯培养鉴定的结果一致,但比例有所差异。

分类号： TS254.7

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