基于RNA-Seq分析茶树新品系‘春绿’生物信息

文献类型： 中文期刊

第一作者： 林郑和

作者： 林郑和;孔祥瑞;陈常颂;李鑫磊;张亚真;游小妹;陈志辉;单睿阳;钟秋生

作者机构：

关键词： 茶树;新品系;转录组;生物信息学

期刊名称： 茶叶学报

ISSN： 2096-0220

年卷期： 2023 年 02 期

页码： 29-36

摘要： 【目的】为加深对茶树新品系‘春绿’分子机制及优异性状的遗传基础的了解。【方法】以茶树品种（系）‘福云6号’和春绿叶片为材料，利用第二代测序技术，构建基因转录本。【结果】获得新品系春绿的Clean reads达到47.37 M，比对照福云6号少0.76 M；共拼装成41 159条unigenes，其中31 706条unigenes能被GO数据库成功注释，分别涉及到3 651个GO组。差异显著基因有7 042条，分别为23个生物学过程的GO组、20个细胞成分的GO组及21个基于分子功能的GO组。KEGG富集分析发现，有8 657个基因注释到191个代谢通路中，这些基因中有1 277个显著差异基因。66条DEGs参与苯丙素的生物合成（ko00940）,3条DEGs参与谷胱甘肽代谢（ko00480）,40条DEGs参与卵母细胞减数分裂（ko04114）,45条DEGs参与RNA降解（ko03018）,14条DEGs参与角质、亚伯碱和蜡的生物合成（ko00073）。【结论】转录组测序分析结果阐明了春绿新品系生长发育的部分分子信息，对利用其进一步开展分子辅助育种等具有较为重要的意义。

分类号： S571.1

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